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 中国生态大讲堂
中国生态大讲堂专题培训班主题:混合效应模型与结构方程模型应用
时间: 2018-05-07  点击率: 67222
 

中国生态大讲堂 专题培训班

主题:混合效应模型与结构方程模型应用

培训班背景

当前,随着生态与环境科学的发展,一些科学问题的回答往往基于结构较为复杂的数据结构之上,导致数据点之间的非独立性问题普遍存在,传统或经典的统计分析方法已很难应对此类数据。出于严肃性的考虑,生态学等领域的科研工作对统计方法的要求也越来越高。面对纷繁复杂的数据,如何选择最为合适的数据分析方法已成为科研工作者,尤其是广大刚面对数据处理工作的研究生们最为头疼的问题之一。混合效应模型与结构方程模型是近年来生态学领域应用十分广泛的统计方法,具有强大的数据分析功能和广泛的适用性。但二者都具有较为庞大的理论体系和复杂多变的形式,使初学者往往无所适从。中国科学院绿色培训基地-中国生态大讲堂根据前两期数据整合分析培训的反馈,面向生态学相关领域的青年科学工作者举办混合效应模型和结构方程模型在生态学中的应用培训和培训班,力图通过与实际应用的结合,采用浅显易懂的讲解,帮助生态学相关领域博士研究生、博士后等青年科学工作者理解和应用这些统计工具解决研究问题,提升他们在生态统计应用方面的能力。

本课程拟较为全面和系统的介绍混合效应模型的基本原理和适用方法,并以R软件为工具,通过实际运算操作讲解,结合案例和学员相关研究问题的交流,让学员熟悉并掌握混合效应模型与结构方程模型的逻辑内含,应用范围和操作步骤,切实提升数据分析能力。

一、时间

2018623~24日(周六~周日),622日下午报到。

二、地点

中国科学院地理科学与资源研究所2421会议室

(北京市朝阳区大屯路甲11号)

三、主办单位

中国生态系统研究网络(CERN)科学委员会秘书处

四、承办单位

中国科学院地理科学与资源研究所

五、培训日程和课程内容

培训内容

授课人

623 (星期六)

09:00-09:30

开班仪式

于秀波

09:30-10:30

课程1:实用统计分析基础(数据的类型与分布,基本统计原理及结果解读)

 

10:30-10:50

茶歇/合影

10:50-11:30

课程2:一般线性模型与广义线性模型、广义加性模型、线性混合模型介绍

 

11:30-13:30

午饭/休息

13:30-15:00

课程3:模型选择(模型对比)与模型加权后参数估计、系统发育回归(系统发育树的构建与应用简介)、贝叶斯分层模型分析方法简介

 

15:00-15:20

  

15:20-16:30

课程4:综合练习,答疑与互动(文献阅读,实际分析中遇到的问题,讨论和确定学员拟回答的科学问题)

 

624 (星期日)

09:00-10:30

课程5:结构方程模型的基本原理和R实现

张育新

10:30-10:50

  

10:50-11:30

课程6:结构方程模型路径选择与设置、模型总体诊断及结果解读

张育新

11:30-13:30

午饭/休息

13:30-15:00

课程7:实际案例讲解与练习,互动答疑

张育新

15:00-15:20

  

15:20, -16:20

课程8:讨论交流

张育新

16:20-16:30

结业/颁发培训证书

于秀波

六、主要授课人简介

本次培训班将邀请中国科学院生态环境研究中心城市与区域生态国家重点实验室两位一线青年科研人员为主要授课人。

张霜,中国科学院生态环境研究中心副研究员,博士。主要从事群落生态学研究,研究方向为种间相互作用的生态效应。2017.1-至今,中国科学院生态环境研究中心,副研究员;2012.7-2016.12,中国科学院生态环境研究中心助理研究员;2008.9-2012.7 中国科学院生态环境研究中心,获博士学位;2005.9-2008.7中国科学院西双版纳热带植物园,获硕士学位;2001.9-2005.7西北农林科技大学获学士学位。近年来,在《Ecology》、《Journal of Ecology》、《Ecosphere》等国内外主流期刊上发表论文十多篇。

张育新,博士,副研究员。主要从事群落生态学、保护生物学、景观生态学和生态模型等方面研究工作。20087-至今中国科学院生态环境研究中心城市与区域生态国家重点实验室副研究员。20087月获中国科学院生态环境研究中心生态学专业博士学位;2003年获北京林业大学生态学硕士学位。201311-201411 加拿大圭尔夫大学环境科学系访问学者。先后主持或参加国家自然科学基金面上项目、国际合作交流项目、973项目、科技支撑项目、环保公益性行业专项及林业公益性行业专项项目等多项研究任务。在生物多样性格局、种间相互作用、生态格局的跨尺度分析、群落群聚规则、非线性生态模型等方面有丰富的经验。在国内外刊物上发论文40多篇。

详见附件《主要授课人简介》。

七、参加人数与要求

参加人数:40人左右。

要求:本班适合有一定数理统计基础的学员,学员招录要求:有基本的数理统计知识,所开展的研究会用到混合效应模型和结构方程模型的优先,在职青年科研人员、博士后、高年级研究生优先,提前汇款者优先。

八、注册费

本次培训班费用2500/人,培训期间提供午餐,其余食宿费用、往返交通费用自理。所收取费用主要用于支付授课人讲课费、后勤人员劳务费和培训组织过程中的资料等费用。如有需要,主办方可协助预定附近酒店(如七天、如家等)。

九、报名方式与时间

本次培训班将面向全国招收学员,拟参加人员于61前通过网络注册报名(注册报名网址:http://cef201806.csp.escience.cn填写注册申请表(网站)并附个人简历(包括专业背景,研究方向,当前开展的研究等)至cef@cern.ac.cn,主办机构将对报名人员进行资格审查,并于62邮件通知审查通过人员确认,62前确定最终名单。

十、培训班联系人

刘宇、李莉

中国科学院地理科学与资源研究所

中国科学院生态系统网络观测与模拟重点实验室

地址:北京市朝阳区大屯路甲11

邮编:100101

Emailcef@cern.ac.cn

报名网址:http://cef201806.csp.escience.cn

 

十一、主办机构简介

中国生态系统研究网络(CERN)是中国科学院知识创新体系的重要组成部分,由1个综合研究中心,5个分中心和44个生态研究站组成。现有2500多名科研人员、技术支撑人员和研究生利用CERN平台,从事生态系统长期监测、试验、研究、示范与咨询工作。

中国生态大讲堂由中国科学院中国生态系统研究网络(CERN)等主办,以传播新知识、交流新思想、展示新成果为宗旨,针对生态学的前沿与热点问题,邀请有关专家进行学术讲演,促进我国生态系统研究、观测与示范等工作的学术交流、成果展示和知识传播。截止到201853日,中国生态大讲堂已成功举办了156次学术报告、19次学术研讨会和4次高级培训班,2次国际培训班,4次焦点论。400多位中外知名学者做了学术报告,参加人员超过9000人次。出版了《中国生态大讲堂系列丛书》5册。第6本正在修改中,促进了科学决策,为决策者、媒体、社会团体搭建与生态学界交流的沟通桥梁。20136月,中国生态大讲堂被人事与社会保障部列入国家级专业技术人员继续教育基地培训点,增强了中国生态大讲堂培训的权威性和影响力。


 

附:

主要授课人简介

张霜,中国科学院生态环境研究中心副研究员,博士。主要从事群落生态学研究,研究方向为种间相互作用的生态效应。2017.1-至今,中国科学院生态环境研究中心,副研究员2012.7-2016.12,中国科学院生态环境研究中心助理研究员;2008.9-2012.7 中国科学院生态环境研究中心,获博士学位;2005.9-2008.7中国科学院西双版纳热带植物园,获硕士学位;2001.9-2005.7西北农林科技大学获学士学位。

代表性论著:

1. Zhang, S., Y. Zhang, and K. Ma. 2017. The association of leaf lifespan and background insect herbivory at the interspecific level. Ecology98:425-432.

2. Zhang, S., Y. Zhang, and K. Ma. 2016. Latitudinal variation in herbivory: hemispheric asymmetries and the role of climatic drivers. Journal of Ecology104:1089-1095. (Edtor choice论文,杂志官方微博推介文章https://jecologyblog.wordpress.com/2016/06/14/editors-choice-1044/)

3. Zhang, S., Y. Zhang, and K. Ma. 2015a. The equal effectiveness of different defensive strategies. Scientific Reports5:13049.

4. Zhang, S., Y. Zhang, and K. Ma. 2015b. Mixed effects of ant–aphid mutualism on plants across different spatial scales. Basic and Applied Ecology16:452-459.

5. Zhang, S., Y. Zhang, and K. Ma. 2015c. Mutualism with aphids affects the trophic position, abundance of ants and herbivory along an elevational gradient. Ecosphere6:art253.

6. Zhang, S., Y. X. Zhang, and K. M. Ma. 2013. The Ecological Effects of Ant-Aphid Mutualism on Plants at a Large Spatial Scale. Sociobiology60:236-241.

7. Zhang, S., Y. Zhang, and K. Ma. 2012a. Disruption of ant-aphid mutualism in canopy enhances the abundance of beetles on the forest floor. PLoS ONE7:e35468.

8. Zhang, S., Y. Zhang, and K. Ma. 2012b. The ecological effects of the ant–hemipteran mutualism: A meta-analysis. Basic and Applied Ecology13:116-124.

9. Zhang, S., Y. X. Zhang, and K. M. Ma. 2012c. Different-sized oak trees are equally protected by the aphid-tending ants. Arthropod-Plant Interactions6:307-314.

10. Xu, G., S. Zhang, Y. Lin, and K. Ma. 2015. Context dependency of the density–body mass relationship in litter invertebrates along an elevational gradient. Soil Biology and Biochemistry88:323-332.

11.张霜, 张育新,马克明. 2010. 保护性的蚂蚁-植物相互作用及其调节机制研究综述. 植物生态学报34:1344-1353.

12.张霜和陈进. 2008. 垂叶榕种子的二次散布:蚂蚁和非蚁传植物互惠关系的新证据. 生态学杂志27:1913-1919.

 


 

张育新,中国科学院生态环境研究中心助理研究员,博士。主要从事群落生态学、保护生物学、景观生态学和生态模型等方面研究工作。20087-至今中国科学院生态环境研究中心城市与区域生态国家重点实验室助理研究员。20087月获中国科学院生态环境研究中心生态学专业博士学位;2003年获北京林业大学生态学硕士学位。201311-201411 加拿大圭尔夫大学环境科学系 访问学者。先后主持或参加国家自然科学基金面上项目、国际合作交流项目、973项目、科技支撑项目、环保公益性行业专项及林业公益性行业专项项目等多项研究任务,在国内外刊物上发论文40多篇。在生物多样性格局、种间相互作用、生态格局的跨尺度分析、群落群聚规则、非线性生态模型等方面有丰富的经验。

代表性论著:

Zhang, S., Zhang Y.X., Ma K.M. 2017. A re-evaluation of hemispheric asymmetries in herbivory: a response to Kozlov & Klemola 2017. Journal of Ecology. DOI: 10.1111/1365-2745.12828

Zhang, L., Zhang Y.X. *, Fan N.Q., Zhang S., Ma K.M., Niu S.K. 2017. Altitudinal variation in ant–aphid mutualism in nitrogen transfer of oak (Quercus liaotungensis). Arthropod-Plant Interactions. DOI: 10.1007/s11829-017-9517-5

Zhang, S., Zhang Y.X., Ma K.M. 2017. The association of leaf lifespan and background insect herbivory at the interspecific level. Ecology, 98(2): 425-432.

Zhang, L., Zhang Y.X. *, Fan N.Q., Zhang S., Ma K.M., Niu S.K. 2017. Altitudinal variation in ant–aphid mutualism in nitrogen transfer of oak (Quercus liaotungensis). Arthropod-Plant Interactions. DOI: 10.1007/s11829-017-9517-5

Zhang, S., Zhang Y.X., Ma K.M. 2017. The association of leaf lifespan and background insect herbivory at the interspecific level. Ecology, 98(2): 425-432.

Zhang, S., Zhang Y.X., Ma K.M., 2016. Latitudinal variation in herbivory: hemispheric asymmetries and the role of climatic drivers. Journal of Ecology, DOI: 10.1111/1365-2745.12588.

Zhang, S. §, Zhang Y. X. §, Ma K.M., 2015. Mutualism with aphids affects the trophic position, abundance of ants and herbivory along an elevational gradient. Ecosphere 6(12):253. http://dx.doi.org/10.1890/ES15-00229.1

Zhang S., Zhang Y.X., Ma K.M., 2015 The equal effectiveness of different defensive strategies. Scientific Reports, 5:1-9.

Zhang S.§, Zhang Y.X.§, Ma K.M., 2015. Mixed effects of ant-aphid mutualism on plants across different spatial scales. Basic and Applied Ecology, 16(5):452-459.

Zhang Y.X., Ma K.M., Anand M., Ye W.H., Fu B.J., 2015. Scale dependence of the beta diversity-scale relationship. Community Ecology, 16(1): 39-47.

Zhang Y.X., Zhang S., Ma K.M., Fu B.J., Anand M., 2014. Woody species diversity in forest plantations in a mountainous region of Beijing, China: Effects of sampling scale and species selection. PLoS ONE 9(12): e115038. doi:10.1371/ journal.pone.0115038.

Zhang S., Zhang Y.X.*, Ma K.M., 2013. The Ecological Effects of Ant-Aphid Mutualism on Plants at a Large Spatial Scale. Sociobiology, 60(3): 236-241.

Zhang YX, Ma K.M., Anand M., Fu B.J., 2011. Multifractal pattern and process during a recent period of forest expansion in a temperate mountainous region of China. Ecological Informatics, 6, 384-390.

Zhang YX, Ma KM, Anand M & Fu BJ, 2006. Do generalized scaling laws exist for species abundance distribution in mountains? Oikos 115: 81-88.

Zhang S.§, Zhang YX§*, Ma K.M.,2012. Different-sized oak trees are equally protected by the aphid-tending ants. Arthropod-Plant Interactions. DOI 10.1007/s11829-011-9172-1.

Zhang S.§, Zhang YX§, Ma K.M., 2012. Disruption of ant-aphid mutualism on canopy enhances the abundances of beetles and spiders on forest floor. PLoS ONE 7(4): e35468. doi:10.1371/journal.pone.0035468.

Zhang S., Zhang YX*, Ma K.M., 2012. The ecological impacts of the ant-hemipteran mutualism on plants: a meta-analysis. Basic and Applied Ecology, 13, 116–124.

Qi J, Ma KM, Zhang YX, 2009. Leaf trait relationships of Quercus liaotungensis along altitudinal gradient in Dongling Mountain, Beijing. Ecological Research, 24, 1243-1250.

张育新, 马克明, 祁建, 冯云, 张洁瑜, 2009. 北京东灵山海拔梯度上辽东栎种群结构和空间分布. 生态学报, 29(6), 2789-2796.

张育新, 马克明, 祁建, 冯云, 张洁瑜, 2009. 北京东灵山辽东栎林植物物种多样性的多尺度分析. 生态学报, 29(5), 2179-2185.

张育新, 马克明, 牛树奎, 2003. 异质种群动态模型:破碎化景观动态模拟的新途径. 生态学报, 23(9): 1877-1890.

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