自2009年4月中旬播种以来，拉萨站试验地接连遭受干旱、霜雹灾害的影响，4月份无降水，5月份降水1.5mm，严重影响了试验地的青稞、小麦、青饲玉米、紫花苜蓿、黑麦草、高羊茅以及温室内外的蔬菜等农作物的生长发育，拉萨站工作人员购买了抽水泵连续三天不间断从拉萨河输水灌溉，支出设备费、劳务费、电费多达2万余元。对于受灾严重的试验小区，重新进行整地、播种、施肥等田间工作，不仅耽误了试验观测进程，亦造成种子费、机械耗油费、劳务费的再支出，约2万元。

8月份降水集中，截止11号，降水量累计达到80mm，尤其是8号和9号，两天降水量之和高达60mm，同时由于站内排灌设施老化，院前沟渠决口，造成10号站内发生水涝，院内积水深45.3cm，极大地影响了生活以及田间工作。

其中两个蔬菜大棚受灾1亩，蔬菜后期基本没有产量；棚外菜地受损1亩，水涝过后污染无法食用，给站内工作人员生活用菜带来极大不便，估计经济损失2万余元。仓库进水使得180袋磷酸二铵、60袋尿素基本报废，直接经济损失约4万余元。

发生涝灾后，站内人员即刻用抽水机排水，之后，重新开展棚内蔬菜种植，并对遭水灾试验地进行补播，但年度试验工作几乎全部受到影响。