2007年9月1日，刘建康院士九十华诞庆贺活动在武汉隆重举行。庆贺活动包括上午在湖北省委洪山礼堂举行的学术报告会和庆祝会，以及下午在水生所举行的“水生生物学发展战略研讨会”。
        中国科学院水生生物研究所和湖北省科学技术协会共同举办了上午的庆祝会。国家自然科学基金委员会主任陈宜瑜院士，中共湖北省委常委吴永文，湖北省政府郭生练副省长，湖北省政协副主席郑楚光、宋德福，国家自然科学基金委员会副主任朱作言院士，中共武汉市委常委、市委办公厅彭丽敏秘书长，中国科学院院士裘法祖、刘瑞玉、杨弘远、赵尔宓、张弥曼、叶朝辉、许厚泽、曹文宣，中国工程院院士唐启升，湖北省和武汉市有关部门的领导，中科院生物局、中国水产学会、中国海洋湖沼学会的代表，相关科研院所和高校的领导和专家，刘建康院士的亲友，以及水生所的离退休老同志、在职职工及研究生等约700人参加了庆祝活动。
        湖北省科协党组书记、常务副主席曲颖和水生所所长桂建芳研究员分别介绍了刘建康院士的简历和学术成就；中科院院士工作局局长马扬宣读了全国人大常委会副委员长、中国科学院院长路甬祥院士的贺信，彭丽敏宣读了中共湖北省委常委、武汉市委书记苗圩的贺信；刘建康院士的学生代表朱作言院士、中科院武汉分院院长叶朝辉院士、吴永文、陈宜瑜院士分别致辞，向刘建康院士表示祝贺。武汉市委书记苗圩、湖北省副省长郭生练、武汉市市长李宪生、中科院水生所、湖北省科协等单位和个人向刘建康院士赠送了生日贺礼献上了鲜花。中科院生物局、中科院资环局等单位或个人还发来了贺电。
        刘建康院士在讲话中对大家的祝贺表示感谢，并特意提到全国政协主席贾庆林8月29日在会见著名农业科学家袁隆平院士时提出要学习袁隆平胸怀祖国、一心为民的坚定信念，自强不息、与时俱进、勇攀高峰的创新精神，不畏艰辛、执著追求、迎难而上的坚强意志，严于律己、淡泊名利、团结协作的高尚情操。刘建康院士表示愿与大家一起以袁隆平院士为榜样，继续在科研领域作出成绩。
        在上午的学术报告会上，水生所的桂建芳研究员和谢平研究员分别以“鱼类性别和生殖——从60多年前刘建康先生关于黄鳝雌雄同体和性反转现象的发现谈起”、“蓝藻的功与过”为题作了精彩的学术报告。
        陈宜瑜院士、朱作言院士、刘瑞玉院士、中科院生物局康乐局长，相关科研院所和高校的专家，水生所的全体研究员等参加了下午的水生生物学发展战略研讨会。大家结合庆贺刘建康院士九十大寿，回顾了水生所的发展史和国内外水生生物学学科发展历程，并围绕水生生物学发展方向、人才引进和培养、新兴学科的发展、传统学科的继承、学术风气的养成等进行了热烈的研讨。陈宜瑜院士、朱作言院士、刘瑞玉院士、康乐局长等做了既热情洋溢又语重心长的发言。